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m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動態發布時間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一，目前主要的研究思路包括差異表達的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章，小編時間和大家分享一下。作者開發這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據這一原理，作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理，然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點，ACA處被完全剪切，測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析（圖3）。細胞核是細胞的控制中心，它包含了遺傳物質DNA，控制著細胞的生長和分裂。海南科研技術服務

3）基因/蛋白質表達定性或定量檢測在進行分子檢測的過程中，保持核酸和蛋白質的完整性至關重要，因此在取樣過程中，應盡量避免核酸及蛋白質的降解。如不注意采樣過程，將會導致樣本中的核酸及蛋白質的無差別降解，嚴重影響后續分子檢測結果。在條件允許的情況下，樣本在離體后應立刻裝入凍存管內，并立即放入液氮中進行冷凍。在RNA提取樣本的保存過程中，可以選擇非冷凍型RNA保存液或Trizol試劑進行RNA酶的。針對蛋白質提取樣本的保存，我們同樣可以使用商品化的蛋白酶劑進行短期處理。聚合酶鏈式反應（PolymeraseChnReaction，PCR）及免印跡（Westernblotting，WB），這兩種實驗手段是分子學檢測中不可或缺的一部分，也是發表至關重要的分子檢測數據。PCR主要用來對基因在基因組層面或轉錄層面的變化進行定性或定量檢測，而WB則主要用來對某一蛋白質的表達進行定量檢測。（4）轉錄組學、蛋白質組學及代謝組學檢測隨著檢測水平及相關產業的不斷發展，各類組學檢測的價格降低，實驗設計中也常常運用組學檢測來提升實驗設計的檔次。在我們進行轉錄組學及蛋白質組學的檢測過程中，同樣是要首先確保目標RNA或蛋白質的片段完整性。河北外包科研技術服務培養細胞培養板的選購要注意哪些?

應退回純酒精中重新脫水，然后再透明，否則切片難以鏡檢。（4）二甲苯應盡量保持無水，應經常更換，或用紗布包無水硫酸銅放入染色缸內吸收水分。5.透蠟注意事項（1）透蠟的目的是除去組織中的透明劑（如二甲苯等），使石蠟滲透到組織內部達到飽和程度以便包埋。透蠟時間根據組織大小而定。（2）盡量保持在較低溫度中進行，以石蠟不凝固為度。（3）透蠟溫度要恒定，不可忽高忽低。（4）操作要迅速，力求在短的時間內完成石蠟透入過程，以免引起組織變硬、變脆、收縮等。（5）注意溫度不要過高，以免組織發脆。6.染色水洗注意事項（1）染色原理：伊紅主要染細胞質，著色濃淡應與蘇木精染細胞核的濃淡相配合，如果細胞核染色較濃，細胞質也應濃染，以獲得鮮明的對比。（2）染色時間應根據染色劑的成熟程度及室溫高低，適當縮短或延長。室溫高時促進染色，染色時間可短些，否則可適當延長時間，冬季室溫低時可放入恒溫箱中染色。（3）注意流水不能過大，以防切片脫落。（4）如果細胞核染色較淺，細胞質也應淡染。可在伊紅乙醇液中滴加數滴冰醋酸助染，促使細胞質容易著色，并且經乙醇脫水時不易褪色。

我們知道WB實驗步驟繁瑣，一次實驗歷時也不短，從提蛋白到顯影結束可能要三天，我們就講一下這里面的一些關鍵環節。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經驗豐富的WB實驗者都深有體會，蛋白提取是影響結重要的環節之一。該過程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點，一是裂解前注意保持樣品處于低溫環境中，二是裂解時加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環灌注，然后冰上取腦，分離各腦區(嗅球，皮層，海馬，中腦，小腦，延髓，丘腦，紋狀體)后置于，用液氮速凍后轉移至-80度冰箱長期保存。接著是保證蛋白濃度，即要加入適量的裂解液，加太少會使蛋白提取不充分，加太多會讓蛋白濃度太低，一般經驗是這樣的，細胞樣品例如一個六孔板的細胞加60微升的裂解液，動物組織的話每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理，具體方案見討論部分。如果沒有超聲破碎儀，那就用1毫升注射器不斷抽吸，冰上反復抽吸1分鐘左右，注意不要產生過多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取，由于文件過大，又比較血腥，不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘，這里的上樣緩沖液有兩種可選。隨著跨學科研究的深入開展，動物疾病模型將在未來發揮更為普遍的作用，成為生命科學、醫學等領域研究工具。

建立疾病模型的目的是為了防治人類疾病。因此，疾病模型研究結果的可靠程度取決于模型與人類疾病的相似或可比擬的程度。接下來就讓上海研錄帶您了解相關知識。一個好的疾病模型應具有以下特點：①能夠再現所要研究的人類疾病，動物疾病表現應該與人類疾病相似；②動物能重復產生該疾病，盡可能能在兩種動物體內復制該病；③動物背景資料完整，實驗動物合格，生命周期要滿足實驗需要;④動物要價廉、來源充足、便于運送；⑤盡可能選用小動物。生物醫學科研專業設計中常要考慮如何建立動物模型的問題，因為很多闡明疾病及療效機制的實驗不可能或不應該在患者身上進行。常要依賴于復制動物模型，但一定要進行周密設計，設計時要遵循下列一些原則：(一)相似性在動物身上復制人類疾病模型，目的在于從中找出可以推演應用于患者的有關規律。外推法(extrapolation)要冒風險，因為動物與人到底不是一種生物。如，在動物身上無效的藥物不等于臨床無效，反之亦然。因此，設計動物疾病模型的一個重要原則是，所復制的模型應盡可能近似于人類疾病的情況。能夠找到與人類疾病相同的動物自發性疾病當然是比較好的。(二)重復性理想的動物模型應該是可重復的，甚至是可以標準化的。如。腫瘤細胞具有極強的增殖能力，在一個適宜,裸鼠成瘤是常見的驗證腫瘤細胞體內增殖模型。河北病理科研技術服務培養

在藥物研發過程中，科研人員可以通過對動物模型進行藥物處理，觀察其療效和副作用，為新藥的試驗提供依據。海南科研技術服務

應根據所檢測指標的要求，需采取不同策略處理。在如今分子學當道的現實背景下，動物實驗除了對實驗動物的體征及生理指標進行全的監控外，各種分子檢測甚至是組學檢測也開始大行其道，動物實驗結束之后的機制研究成為了實驗的重頭戲。一般來說，動物實驗檢測對象主要包括：（1）體液中各類因子定性及定量檢測由于此類檢測對象多為蛋白及各類小分子物質，因此在取樣過程中應注意防止此類物質降解，在獲取后，應及時置于溫（≤-80℃）進行保存，在后續實驗過程中，也應當注意保存條件的穩定性，避免反復凍融。常用的方法便是酶聯免吸附測定（ELISA），除此之外，可利用生化分析儀及不同檢測方法的（比色法、比濁法等）方法對各類生化指標及因子進行定性及定量檢測。（2）生理變化及免組化檢測常用的理檢測多使用H&E染色對細胞質及細胞核進行染色標記，以觀察細胞變化。除此之外，許多特殊染色也在理生理變化中得到了應用，如利用Masson染色檢測纖維化變，Nissl染色檢測神經元損傷，β-半乳糖甘酶染色檢測細胞衰老等。此外，還可以通過免組化技術對某些特異性標記物進行免顯色檢測，達到原位定性或定量檢測的目的。。海南科研技術服務